В 1791 г. указом Екатерины II главе армянской общины И.Л. Лазареву было разрешено возвести по проекту Ю. М. Фельтена на участке рядом со Смоленским лютеранским кладбищем «для погребения умирающих армян небольшую каменную церковь» вместе с богадельней. Эта церковь была задумана Лазаревым как семейная усыпальница. Вскоре была сооружена часовня, где первым был похоронен сын Лазарева - Артемий, адъютант кн. Г. А. Потемкина-Таврического, погибший в начале 1791 г. на русско-турецкой войне, а затем и сам И. Л. Лазарев, скончавшийся осенью 1801 г.
В часовне было поставлено великолепное двойное надгробие, исполненное в 1802 г. академиком И. П. Мартосом. В 1808 г. брат Лазарева — Мина поручил подрядчику Кузьме Васильеву выстроить церковь, украшенную портиками и большим куполом, которая была возведена по проекту Л. Руска на месте часовни и 5 октября 1808 г. освящена во имя Воскресения Христова. К началу XX в. в церкви находилось около 30 захоронений рода Лазаревых и других знатных семей армянского происхождения: Абамелек, Деляновых, Сумбатовых, родственно связанных с Лазаревыми. В XIX веке вокруг церкви образовалось армянское Лазаревское кладбище, позднее ставшее отделением Смоленского. В сентябре 1988 г. церковь вернули армянской общине, и 8 октября того же года в ней состоялось первое богослужение. После реставрации храм в 1989 г. был освящен.